ShortReadManager 4+
膨大なNGSデータを、自分で処理しましょう！
Yoshiyuki Ohtsubo
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- 無料
スクリーンショット
説明
ショートリードでお困りですか？k-merの出現頻度に基づいて、エラーを除去したりできます。
次世代シーケンサーでデータを取得すると、たくさんのリードが手に入ります。でもリードには一定の割合でエラーが含まれているので、注意が必要です。あるゲノム配列を例えば100xのカバレージで読んだ時に、1回しかでてこない31-merは、きっと何か偶発的な理由で、生じたものだとみなすことができます。偶発的な理由とは、例えばシーケンサーの読み取りエラーです。他にも、ゲノム配列とアダプター配列のジャンクション部分も、偶発的に生じ、出現頻度は低くなります。
リード中の底頻度部分を切りとばすと、その後の処理が楽になります。
新機能
バージョン 1.08
マイナーアップデートです
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データの収集なし
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情報
- 販売元
- Yoshiyuki Ohtsubo
- サイズ
- 15.5MB
- カテゴリ
- 教育
- 互換性
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- Mac
- macOS 10.13以降が必要です。
- 言語
-
英語
- 年齢
- 4+
- Copyright
- © 2021 Yoshiyuki Ohtsubo
- 価格
- 無料