「Star Trek™ 艦隊コマンド」では、SFドラマシリーズ「スタートレック」のヒーローや悪役、艦船や派閥が入り乱れ、ドラマの中ではありえないような戦いが繰り広げられます。
「スタートレック」の物語に魅了された人なら、もしも、クリンゴン人がエンタープライズ号の船長だったら、あるいは、ミスター・スポックがロミュラン帝国の勝利のために戦うことになったらどうなるか、そのような想像を一度はしたことがあるでしょう。そんな想像の結果がどうなるのか、ゲームの中で体験できます。
本作では、J.J. Abrams監督が手がけた映画版「スター・トレック」の、洗練されたきらびやかな世界観の下、基地建設の戦略を練りながら、リアルタイムの宇宙船バトルを楽しめます。
プレイヤーは巨大な宇宙基地を強化して、Chris Pineさんが扮するカーク船長など、キャラクターを宇宙船のクルーに加えていきます。ほかにも、「スタートレックVI 未知の世界」に登場したシェークスピア好きのクリンゴン人や、チャン将軍など、「スター・トレック」シリーズの人気キャラクターがたくさん登場します。
基地の管理から任務の遂行まで、プレイヤーがやるべきことはたくさんあります。親切なAIコンパニオンの力を借りて、凶暴なノーシカン人と戦い、あなたの助けを必要とする、あるいはあなたを倒そうとする、大勢のキャラクターと出会いましょう。
新たに建造した船がドックを発進する場面は壮観です。J.J. Abrams監督作品ではおなじみの、レンズフレア効果のような演出が壮大な雰囲気をいっそう盛り上げます。AR（拡張現実）機能を使えば、お気に入りの艦船が自宅のリビングルームを飛ぶ様子を撮影することもできます。
任務によっては「スタートレック」らしい、苦渋の決断を下さないといけない場面にも出会うでしょう。例えば、拘束したクリンゴン人のスパイを解放すべきか、船倉に閉じ込めておくべきか。あるいは、不時着した輸送船のクルーを治療するようマッコイに命じるか、引き裂かれた船体の修理を優先させるようスポックに促すか。すべてはあなたの選択次第です。
強力な武器やシールドで船を武装したら、さらに危険な領域へと進出できます。ですが前人未到の地へと足を踏み入れる前に、ゲーム内でほかのプレイヤーと同盟を組みましょう。チームを組む目的が小惑星での資源採掘であれ、敵基地への総攻撃であれ、最後のフロンティアで友を持つのは素晴らしいことです。