目が覚めると、自分の右手に不思議な生物が寄生していることに気がつきます。その生き物は、「はじめまして、やどぬし。」と微笑みながら話しかけてきます。「パラサイトデイズ」は、この人造寄生生物011号との、不思議な日々を過ごすゲームです。
あなたが目覚めたのは、実験施設のような場所です。実験の目的は、人造寄生生物に寄生された人間のデータを記録し、検証することです。寄生生物は被験者の生命力を奪って成長し、これまで実験を続けた被験者の生存例はありません。あなたはあらゆる手段を尽くし、生き延びることを目指します。
あなたの生命力は、数値化されて確認でき、生命力がなくなればゲームオーバーです。ミニゲームやゲーム内の行動で獲得できるポイントを使って食事をし、生命力を養います。数日おきに起こる、寄生生物の発作によって、生命力が急速に吸収されてしまうので注意してください。選ぶ食べ物によって、生命力の増加率は変わるので、生き延びるために慎重に身体作りを行いましょう。
不気味な実験とは裏腹に、寄生生物との和やかな暮らしが展開されます。食べた物の感想を話したり、寄生生物から質問を投げかけられたりします。自分の生命力を奪っていく存在でありながら、好奇心旺盛で人懐っこい寄生生物が、次第に愛らしく思えてくるかもしれません。
寄生生物との会話や、実験の過程で選択した行動によって、成長度、ラブ度、免疫力という数値も上下します。これら数値の変化によって物語は様々な方向へ分岐していきます。寄生生物を育てていくのか、次第に明らかになる真実を探究していくのか。複数のエンディングが用意されています。あなたと寄生生物はどのような結末を迎えるのでしょう。寄生生物との奇妙な暮らしを始めてみませんか。