私立希望峰學園一直貫徹英才教育，學生們都在各自領域中擁有過人的「超高中級」能力，前途無量。然而，成功進入這所高中的「日向創」，卻在踏入校門之後昏倒了。醒來後，他發現自己與其他超高中級的學生們來到了賈巴沃克群島，並捲入一場鬥智鬥力的生存淘汰之中。
這是知名懸疑冒險遊戲《超級槍彈辯駁2 再會了絕望學園》的故事背景。如今，《第五人格》把這場超高中級的頭腦對決，帶到了監管者與求生者之間的追逃競技之中。
《第五人格》以一名負責追捕的監管者和四名試圖逃脫的求生者，構成一場場非對稱式的鬥智競技。雖然在遊戲規則上與《槍彈辯駁》系列大異其趣，但兩者都要求玩家絞盡腦汁、耗費腦力揪出對手並生存下來。在這次跨界連動中，你將能以《超級槍彈辯駁2 再會了絕望學園》數名超高中級角色的形象，走進恐怖莊園。
求生者「傭兵」能扮演「狛枝凪斗 」、「醫生」扮演「罪木蜜柑 」、「機械師」則是「七海千秋」，當然還有「探勘員」扮演的主角「日向創」；甚至連遊戲吉祥物之一，自稱為超高中級學生們班主任的粉紅布偶兔「莫諾美」也成為隨從寵物登場。
原作之中，超高中級學生們經過連串的猜忌、信賴破壞，才逐漸讓真相浮現。這次他們得齊心協力，才能從《第五人格》監管者的追捕下逃出生天。