PlateGuide
Productivity
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PlateGuide 是一款专为生命科学、医学及分子生物学科研人员打造的 RT-qPCR 实验设计与数据分析工作流工具。涵盖“RNA 提取质控 -> 逆转录体系配平计算 -> 96/384 孔板排布设计 -> qPCR 原始数据解析与统计出图”的完整数据闭环。
告别混乱的草稿纸记录、繁琐易错的手工 Excel 公式,让从样本制备到定量分析的每一步都精确、规范、可追溯。
【核心功能亮点】
【RNA 提取质控与样本批次管理】
- 详尽参数记录:规范记录提取日期、组织或细胞来源、洗脱体积与可用体积。
- 浓度与纯度质控:录入 Nanodrop 或光度计测定的样本浓度、A260/A280 及 A260/A230 纯度比值。
- 自动产量换算:自动计算各样本 RNA 总产量与质量评估,便于下游逆转录筛选合格样本。
【逆转录 cDNA 合成智能配平与 Mix 计算器】
- 目标投入量自动配平:输入目标 RNA 投入量(例如统一 1000 ng),系统自动计算各孔所需样本体积与无核酸酶水的补足量。
- Master Mix 试剂配制方案:根据样本总数与损耗系数,自动计算酶、Buffer、引物等反应组分的总体积,配液一目了然。
- 反应程序归档:支持记录热循环逆转录程序与模板批次,实验条件清晰可溯。
【96 / 384 孔板排布设计与模板库】
- 矩阵智能排布:只需输入样本列表与目标基因,系统自动按生物学重复与技术重复生成标准孔板矩阵。
- 96 孔板与 384 孔板支持:自由适配常规及高通量反应板,清晰区分内参基因、靶基因与阴性对照。
- 灵活的 CSV 导入导出:支持使用 CSV 批量导入实验孔位布局,也可一键导出板次清单供实验台查阅。
- 预设与模板复用:常用引物和实验方案可保存为通用模板,后续实验一键调用。
【qPCR 原始数据解析与出版级统计出图】
- XLSX 结果导入:支持导入包含 Well 孔位及 Cq / Ct 列的 XLSX 结果文件,按孔位匹配实验布局。
- 自动孔位匹配:根据实验设计自动将仪器数据与样本、基因信息对齐,无需手动逐行复制粘贴。
- 相对定量自动化分析:内置标准 Delta-Delta Ct (2^-ddCt) 算法,自动校准内参基因与对照组,并支持多因素方差模型与组间显著性分析。
- 出版级学术图表导出:自动生成带 SD / SEM 误差线的柱状图或散点图,支持 Log2 相对表达量展示,一键导出高清图表与结果统计表。
【多端协作与私有安全】
- 私有 iCloud 云同步:数据仅在登录相同 Apple ID 的 iPad 与 iPhone 之间通过 CloudKit 私有数据库同步,数据绝不经过第三方服务器,严格保障科研数据保密性。
- 离线可用,纯净无广告:无需注册任何第三方账号,无广告干扰,无后台追踪,断网状态下所有计算与分析均正常可用。
- 完备的数据保护:内置 30 天防误删回收站机制,并支持生成独立的单文件备份(.plateguidebackup)。
more 本次更新让逆转录配液更灵活,并完善用量展示、产物确认与参数保存体验。
1.2.2 新增与改进
• 逆转录支持小数份数,最低 0.5 份,手动输入最多两位小数;留空时根据可用 RNA 量,按 0.1 份向下取整自动计算。
• RNA、试剂、补水及最终产物体积随所选反应份数按比例换算。
• 配液表新增 RNA 总投入(ng)显示,方便核对每份用量与实际总量。
• 已有批次保留原计算规则,可按需启用小数份数;调整配方后需重新确认 cDNA 产物库存。
• 完善逆转录参数校验和产物确认流程,参数保存失败时保留已输入内容。
1.2 系列亮点
• 统一 iPhone 和 iPad 的工作流入口,优化导航及横竖屏操作。
• 批次与板次支持搜索、排序、归档和批量管理,并可从回收站恢复误删内容。
• 改进 RNA 连续录入与逆转录配液表,支持逐项或整列标记加样进度。
• 完善记录搜索与筛选,支持 Excel 结果导入、孔位匹配和导入前核对。
• 丰富 qPCR 分析方案,支持时间比较、多因素分析、扩增效率校正及符合条件的同源配对分析。
• 新增数据检查与 96/384 孔板质控视图,方便核对内参、复孔和异常孔位。
• 丰富多基因图表与历史结果展示,支持 CSV、Excel 和图片导出。
1.2.2 2d ago
本次更新优化数据导入与实验操作体验,并完善配液计算和数据关联。
1.2.1 修复与改进
• 优化 qPCR 结果导入体验,完善数据识别与操作提示。
• 改进逆转录和 PCR 配液计算,完善 cDNA 库存与用量核对。
• 完善样本来源关联,优化板次与实验记录的操作衔接。
• 优化界面显示与交互细节,修复已知问题。
1.2 系列亮点
• 统一 iPhone 和 iPad 的工作流入口,优化导航及横竖屏操作。
• 批次与板次支持搜索、排序、归档和批量管理,并可从回收站恢复误删内容。
• 改进 RNA 连续录入与逆转录配液表,支持逐项或整列标记加样进度。
• 完善记录搜索与筛选,支持 Excel 结果导入、孔位匹配和导入前核对。
• 丰富 qPCR 分析方案,支持时间比较、多因素分析、扩增效率校正及符合条件的同源配对分析。
• 新增数据检查与 96/384 孔板质控视图,方便核对内参、复孔和异常孔位。
• 丰富多基因图表与历史结果展示,支持 CSV、Excel 和图片导出。
1.2.1 3d ago
PlateGuide 1.2.0
这次调整了界面和实验录入,也增加了几项 qPCR 分析和数据检查功能。
界面和导航
• iPhone 和 iPad 现在使用同样的五个入口:总览、提 RNA、逆转录、板次、记录。设置移到工具栏。
• iPad 可以在侧栏里选择实验,再进入批次或板次列表。收起再打开侧栏时,会留在刚才的位置。
• 调整页面切换和返回操作,减少重复选择和来回弹窗。切换工作流或旋转屏幕时,保留已选内容和填写的数值。
• 删掉重复标题和说明,改了一些难懂的按钮名称。单位放在数值旁,长说明收进详情,实验警告和错误提示仍直接显示。
批次和板次
• 批次、板次列表可以搜索,也可以手动排序,或按名称、日期排序。
• 支持重命名、复制配置、归档和取消归档,也可以一次选择多项处理。
• 删除前会说明影响;误删的内容可以到回收站恢复。
提 RNA
• iPhone 把样本名、浓度和可用体积放在同一行,录入时不用反复上下找。
• iPad 按屏幕宽度排列分组,竖屏两列,横屏空间足够时三列。
• 调整了“上一个样本”“下一个样本”“清除”和“完成”操作,连续填写或旋转屏幕时保留已输入的值。
• 修复从提 RNA 切到逆转录时,偶尔出现的键盘残留和页面空白。
逆转录
• 打开页面先看到配液表:每行一个样本,每列一种试剂,按反应步骤分开,方便拿着同一种试剂逐个样本加。
• 左右滚动表格时,样本名固定在左侧。调整了长试剂名的表头、列宽和单位显示。
• 调整单格和整列的完成标记,方便核对哪些已经加过。
• 模板和计算说明可以展开查看;温度、时间、配制顺序和警告保留在配液表附近。
记录和结果导入
• 记录页可以查看当前实验的检测记录,按板次、导入状态筛选,按日期或板次名称排序。
• 支持搜索板次、文件名、日期和备注。搜索结果会标出匹配文字,并显示当前筛选条件。
• 改进 Excel 文件读取,能从多个工作表中查找结果,也能识别不在第一行的表头。按实际孔位与保存的板图匹配,支持 A01 等写法。
• 导入前会列出实验、板次、检测日期和文件,说明匹配了多少布局孔、还有哪些需要核对。只按孔位匹配、部分导入和替换旧结果,需要分别确认。
• 确认按钮固定在底部;还有项目没确认时,会列出来并提供跳转。取消不会留下空记录,导入成功后可以回到原方案或查看分析。
分析方案
• 可以选择要回答的问题:比较指定两组、不同时间、因素的总体效应,或因素之间的交互作用。
• 新增同源样本的两条件配对检验。配对按生物学来源匹配,要求两边样本完整对应,且每一对来自同一次运行。
• 可以为目标基因和内参填写扩增效率,用于校正计算。
• 新建方案会预填可用信息,列出还缺什么。没有方案时直接开始新建,只有一个方案时直接打开,有多个时再选择。
• 已删除或不可用的来源记录,可以从编辑中的方案移出。取消编辑不会改动原方案。
数据检查
• 增加内参跨组漂移、多内参一致性、阴性对照扩增、高 Cq 和疑似离群复孔的提示。
• 可以在 96/384 孔板上查看 Cq 和异常位置,同时核对点板时记下的跳孔或异常。
• 排除某个孔时需要填写原因,原始 Cq 会保留,也可以恢复这个孔。提示出的疑似异常由你核对后处理。
• 分开列出缺失数据、重复检测、生物学样本数和受影响的比较,说明哪些比较可以检验,哪些暂时只能查看描述结果。
图表和历史结果
• 增加多基因结果汇总。iPad 宽屏可以并排看基因卡片和分面图,窄屏则按页查看,并显示分面名称和页码。
• 调整散点、中心线和误差线的样式,加入参照基准线,误差线、图注和汇总数值使用同一设置。
• 时间信息完整时,横轴按真实时间间隔显示;明确标为同一来源的样本,可以查看描述性的时间连线。
• 可以更换横轴、颜色分组和分图方式,也可以把本次显示保存为方案默认设置。换图的显示方式不会重新计算统计结果。
• 导出的 PNG 包含全部分面,并使用相同的纵轴范围。CSV、Excel 和图片对应同一份已保存结果。
• 在应用运行期间,记住同一方案里正在看的基因和比较。方案或数据改变后,会提示更新结果;旧结果仍保留。
• 修复历史结果中显示了后来替换的文件名的问题,并补充扩增效率数据在备份、恢复和旧版本读写时的保护。
1.2.0 Oct 24
本次更新带来全新的 qPCR 分析工作区,让数据核对、统计分析和结果导出更连贯。
• 新增跨记录、时间与多因素分析,可保存分析方案并查看历史结果。
• 新增按基因查看的表达量图、时间趋势和完整比较结果,支持导出 CSV、Excel 与图片。
• 导入 qPCR 结果前可预览匹配情况,并检查重复孔、样本与靶标冲突及异常数值。
• 改进时间信息匹配与历史数据重新导入,修复部分记录无法生成时间分析的问题。
• 修复部分情况下完整备份创建失败的问题,并完善备份内容校验。
1.1.3 Oct 19
本次更新优化自动建板与配液准备,让多板实验的设计和用量核对更清楚。
1.1.2 修复与改进
• 优化非常规样本/基因组合下的自动排板,提高点板效率。
• 新增同一实验未点板板次的 cDNA 总需求汇总,方便提前核对多板用量。
• 修复样本改名或同名时的 cDNA 来源匹配,完善逆转录产物量与用量提示。
• 新增自动建板保存前的基因、内参校验,并完善多轮 PCR 体系的逐轮核查提示。
1.1 系列亮点
• 更清晰的板次管理,更顺手的孔位编辑;
• 板次与孔位编辑体验升级,适配 iPhone 和 iPad 横竖屏,支持缩放、移动与选孔。
• 多项 UI 与操作优化。
1.1.2 Oct 15
本次更新改进数据保存与恢复,并修正配液计算和编辑问题。
1.1.1 修复与改进
• 修复读取异常后保存数据时,部分记录可能被错误移除的问题。
• 改进回收站恢复,正确处理项目所属实验及关联数据。
• 修复特定情况下无酶水用量计算错误的问题。
• 修复删除或复制批次后,实验与批次选择不一致的问题。
• 修复编辑预设时加样体积可能出现精度丢失的问题。
• 修复部分操作导致已保存的批次、板次顺序意外改变的问题。
1.1 系列亮点
• 板次管理更清晰,孔位编辑更顺手,适配 iPhone 和 iPad 横竖屏,支持孔板缩放、移动与选孔。
• 多项界面与操作体验优化。
1.1.1 Oct 13
• 优化板次页,配液信息与孔位布局更清晰。
• 改进孔位编辑,适配 iPhone 和 iPad 横竖屏,支持孔板缩放、移动与选孔。
• 支持调整实验分组顺序。
• 逆转录配体系支持点按列标题整列标记完成,再次点按取消标记。
• 修复已知问题。
1.1.0 Oct 12
修复回收站及数据恢复相关问题,避免已恢复的记录被误删除。
修复特定情况下 iCloud 同步失败或数据状态异常的问题。
1.0.2 Oct 11
更新 App 图标,优化图标的轮廓与视觉层次。
修正 App Store 中的简体中文语言信息。
1.0.1 Oct 6
本次更新让逆转录配液更灵活,并完善用量展示、产物确认与参数保存体验。
1.2.2 新增与改进
• 逆转录支持小数份数,最低 0.5 份,手动输入最多两位小数;留空时根据可用 RNA 量,按 0.1 份向下取整自动计算。
• RNA、试剂、补水及最终产物体积随所选反应份数按比例换算。
• 配液表新增 RNA 总投入(ng)显示,方便核对每份用量与实际总量。
• 已有批次保留原计算规则,可按需启用小数份数;调整配方后需重新确认 cDNA 产物库存。
• 完善逆转录参数校验和产物确认流程,参数保存失败时保留已输入内容。
1.2 系列亮点
• 统一 iPhone 和 iPad 的工作流入口,优化导航及横竖屏操作。
• 批次与板次支持搜索、排序、归档和批量管理,并可从回收站恢复误删内容。
• 改进 RNA 连续录入与逆转录配液表,支持逐项或整列标记加样进度。
• 完善记录搜索与筛选,支持 Excel 结果导入、孔位匹配和导入前核对。
• 丰富 qPCR 分析方案,支持时间比较、多因素分析、扩增效率校正及符合条件的同源配对分析。
• 新增数据检查与 96/384 孔板质控视图,方便核对内参、复孔和异常孔位。
• 丰富多基因图表与历史结果展示,支持 CSV、Excel 和图片导出。
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